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《生物化学与分子生物学》
《生物化学与分子生物学》
分子生物学绪论
一、分子生物学的基本含义
二、分子生物学的主要研究内容
三、分子生物学与其他学科的关系
四、分子生物学发展简史
(一)准备和酝酿阶段
(二)现代分子生物学的建立和发展阶段
(三)初步认识生命本质并开始改造生命的深入发展阶段
第一章 蛋白质化学(Chemistry of Protein)
第一节 蛋白质分子的组成
一、蛋白质的元素组成
二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸
三、氨基酸的分类
第二节 蛋白质分子中氨基酸的连接方式
第三节 蛋白质的结构及其功能
一、蛋白质的一级结构
二、蛋白质的空间结构
(一)蛋白质的二级结构
(二)超二级结构和结构域
(三)蛋白质的三级结构
(四)蛋白质的四级结构
三、蛋白质的结构与功能的关系
第四节 蛋白质的理化性质
一、蛋白质的胶体性质
二、蛋白质的两性电离和等电点
三、蛋白质的变性
四、蛋白质的沉淀
五、蛋白质的呈色反应
第五节 蛋白质的分类
参考资料
蛋白质一级结构的测定方法
第二章 酶(Enzyme)
第一节 酶的作用特点
第二节 酶的分类和命名
一、酶的分类
二、酶的命名
第三节 酶的分子组成和化学结构
一、酶的分子组成
二、酶的分子结构和活性中心
第四节 酶的作用机理
一、酶作用在于降低反应活化能
二、中间复合物学说
三、酶作用高效率的机理
第五节 酶促反应的动力学
一、酶浓度对反应速度的影响
二、底物浓度对反应速度的影响
三、pH对反应速度的影响
四、温度对反应速度的影响
五、抑制剂对反应速度的影响
六、激活剂对酶促反应速度的影响
第六节 酶在体内存在的几种主要形式
一、酶原
二、同工酶
三、变构酶
四、修饰酶
五、多酶复合体
参考资料
别构机制的模式
第三章 维生素(Vitamins)
第一节 脂溶性维生素
一、化学特点
1.维生素A
2.维生素D
3.维生素E
4.维生素K
二、生理作用
第二节 水溶性维生素
一、维生素B复合体
二、维素素C和P
第四章 糖代谢
第一节 概述(overview)
一、代谢的基本概念(Basis concepts of Metabolism)
二、食物中糖的消化和吸收(Digestion and absorption of carbohydrates)
三、糖的主要生理功能(Functions of carbohydrate)
第二节 糖的分解代谢(catabolism of carbohydrate)
一、糖酵解途径(glycolytic pathway)
(一)葡萄糖的转运(transport of glucose)
(二)糖酵解过程
(三)丙酮酸在无氧条件下生成乳酸
(四)糖酵解及其生理意义
(五)糖酵解的调节
二、糖的有氧氧化
(一)有氧氧化过程
(二)糖有氧氧化的生理意义
(三)糖有氧氧化的调节
(四)有氧氧化和糖酵解的相互调节
三、磷酸戊糖途径
(一)反应过程
(二)生理意义
四、糖醛酸代谢
五、其它单糖的酵解
第三节 糖异生
一、糖异生的途径
(一)由丙酮酸激酶催化的逆反应是由两步反应来完成的。
(二)由己糖激酶和磷酸果糖激酶催化的两个反应的逆行过程
二、糖异生的生理意义
(一)糖异生作用的主要生理意义
(二)糖异生作用与乳酸的作用密切关系
(三)协助氨基酸代谢
(四)促进肾小管泌氨的作用
三、糖异生的调节
(一)激素对糖异生的调节
(二)代谢物对糖异生的调节
第四节 糖原的合成与分解
一、糖原的合成
二、糖原的分解
三、糖原代谢的调节
(一)糖原代谢的别构调节
(二)激素的调节
第五节 血糖及血糖含量调节
一、血糖的来源和去路
二、激素对血糖的调节作用
三、神经调节
四、糖代谢障碍
第五章 脂类代谢
第一节 概 述
一、脂类的分类及其功能
二、脂类的消化和吸收
第二节 血脂及其代谢
一、血浆脂蛋白的分类
二、血浆脂蛋白的组成
(一)脂蛋白中脂类的组成特点:
(二)载脂蛋白(apoprotein,apo)
(三)脂蛋白的代谢
(四)高脂蛋白血症
第三节 甘油三酯代谢
一、甘油三酯的分解代谢
二、甘油三酯合成代谢
(一)甘油一酯途径
(二)磷脂酸途径
(三)不同组织甘油三酯合成特点
第四节 脂肪酸代谢
一、脂肪酸的氧化分解
(一)脂肪酸的β-氧化过程
(二)脂肪酸β-氧化的生理意义
(三)脂肪酸的特殊氧化形式
(四)酮体的生成与利用
二、脂肪酸的合成
(一)软脂酸的生成
(二)其它脂肪酸的生成
(三)脂肪酸合成的调节
(四)前列腺素、血栓素及白三烯
三、PG、TX及LT的生理功能
(一)PG
(二)TX
(三)LT
第五节 磷脂代谢
一、甘油磷脂的代谢
(一)分类及生理功能
(二)甘油磷脂的合成
(三)甘油磷脂的分解
二、鞘磷脂的代谢
(一)鞘磷脂的合成
(二)鞘磷脂的分解
第六节 胆固醇代谢
一、肝胆固醇的来源及释放途径
(二)合成原料
(三)合成基本过程
(四)胆固醇合成的调节
二、胆固醇的转化
第六章 生物氧化(Biological oxidation)
第一节 概 述
一、生物氧化酶类
二、生物氧化的基本概念
第二节 呼 吸 链
一、呼吸链的组成
(一)尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)或称辅酶I(CoI)。
(二)黄素蛋白(flavoproteins)
(三)铁硫蛋白(iron?sulfur proteins,Fe-S)
(四)泛醌(ubiquinone,UQ或Q)
(五)细胞色素体系
二、呼吸链中各种传递体的排列顺序
(一)确定排列顺序的方法
(二)氧化呼吸链
三、胞浆中NADH的转移
1.α磷酸甘油穿梭(glycerol?α-phosphateshuttle)
2.苹果酸,天冬氨酸穿梭(malate aspartate shuttle):
第三节 ATP的生成、储存和利用
一、ATP的生成方式
(一)底物水平磷酸化(substrate level phosphorylation)
(二)氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)
二、氧化磷酸化偶联部位的测定
(一)P/0值测定
(二)根据氧化还原电位计算电子传递释放的能量是否能满足ATP合成的需要
三、氧化磷酸化中ATP生成的结构基础
四、氧化磷酸化的偶联机制
五、氧化磷酸化抑制剂
六、氧化磷酸化的调节
七、高能磷酸化合物的储存和利用
(一)高能化合物
(二)ATP能量的转移
(三)磷酸肌酸
第七章 氨基酸代谢
第一节 氨基酸的一般代谢
一、氨基酸的脱氨基作用
二、氨的代谢
二、α-酮酸的代谢
三、脱羧基作用
第二节 个别氨基酸代谢
一、一碳单位代谢
二、含硫氨基酸的代谢
三、芳香族氨基酸的代谢
四、支链氨基酸的代谢
第三节 氨基酸的生物合成
第八章 核苷酸代谢(Nucleotide Metabo lism)
第一节 核苷酸的化学结构
第二节 嘌呤核苷酸的合成代谢
一、嘌呤核苷酸的合成
(一)嘌呤核苷酸的从头合成
(二)补救合成途径:
第三节 嘧啶核苷酸的合成代谢
第四节 脱氧核糖核苷酸的生成
(一)脱氧核糖的生成:
(二)脱氧核糖核苷酸合成的调节
(三)脱氧胸腺嘧啶核苷酸的生成
第五节 核苷酸的分解代谢
一、嘌呤的分解代谢
二、嘧啶核苷酸的分解代谢
第九章 物质代谢调节(Regulation in Metabolism)
第一节 细胞水平的代谢调节
一、细胞内酶的分隔分布
二、酶分子结构的调节
(一)变构调节
(二)酶分子化学修饰调节
三、酶含量调节
(一)酶蛋白合成的诱导和阻遏
(二)酶分子降解的调节
第二节 激素对物质代谢的调节
(一)cAMP是激素在细胞内的信使
(二)cAMP依赖性蛋白激酶是cAMP的靶分子
第三节 物质代谢的整体调节
第十章 血浆蛋白与凝血
第一节 血浆蛋白质
一、白蛋白
二、金属结合蛋白
三、铜蓝蛋白(ceruloplasmin;Cp)
第二节 血液凝固
一、血液凝固的机理
二、凝血酶原激活物的生成
(一)内源性途径
(二)外源性途径
三、凝血酶原的激活
四、纤维蛋白原转变为纤维蛋白
五、凝血作用的调节
六、纤维蛋白溶解
(一)纤维蛋白溶解机理
(二)纤溶抑制物
第三节 红细胞的代谢
一、血红素的生物合成
(一)血红素的合成通路(过程)
(二)血红素合成的调节
二、成熟红细胞的代谢特点
(一)糖酵解
(二)2,3-二磷酸甘油酸(2,3-BPG)支路
(三)磷酸戊糖通路
第十一章 肝脏的生物化学
第一节 肝脏的化学组成特点
第二节 肝脏在物质代谢中的作用
一、肝脏在糖代谢中的作用
二、肝脏在脂类代谢中的作用
三、肝脏在蛋白质代谢中的作用
四、肝脏在维生素代谢中的作用
五、肝脏在激素代谢中的作用
第三节 肝脏的生物转化作用
一、肝脏生物转化的概述
二、生物转化反应类型
(一)氧化反应
(二)还原反应
(三)水解反应
(四)结合反应
三、影响生物转化的因素
第四节 胆汁酸代谢
一、胆汁酸的种类
二、初级胆汁酸的生成
三、次级胆汁酸的生成及胆汁酸的肠肝循环
四、胆汁酸的生理功能
第五节 胆色素代谢
一、胆红素的生成及转运
(一)胆红素的来源
(二)胆红素的生成
(三)胆红素在血液中的运输
二、胆红素在肝脏中的代谢
(一)肝细胞对胆红素的摄取
(二)肝细胞对胆红素的转化作用
(三)肝脏对胆红素的排泄作用
三、胆红素在肠道中的转变
四、血清胆红素与黄疸
第十二章 钙磷代谢及微量元素
第一节 钙磷代谢
一、血钙和血磷
二、钙、磷的吸收与排泄
(一)钙、磷的吸收
(二)钙和磷的排泄
三、钙、磷与骨的钙化及脱钙
(一)骨的组成
(二)成骨作用与钙化
(三)溶骨作用与脱钙
四、钙磷代谢的调节
(一)甲状旁腺素(Parathormone,PTH)
(二)1,25-(OH)[XB]2[/XB]D[XB]3[/XB]
(三)降钙素(CalcitoninCT)
第二节 镁的代谢
(一)镁的吸收与排泄
(二)镁的生理功能
第三节 微量元素
一、铜
二、锌
三、碘
四、锰
五、硒
六、氟
七、钒
第十三章 结缔组织生化(Biochemistryof Connective Tissue)
第一节 蛋白多糖
一、化学结构
二、蛋白多糖的生理功能
三、蛋白多糖的生物合成
四、蛋白多糖的分解代谢
第二节 胶原蛋白
一、胶原蛋白的结构
二、胶原的生物合成
1.细胞内合成阶段
2.细胞外胶原纤维成熟阶段
三、胶原的分解代谢
第三节 弹性蛋白及角蛋白
一、弹性蛋白
二、角蛋白
第四节 结缔组织代谢的调节
第十四章 神经组织生化(Biochemistry of Neural Tissue)
第一节 血脑屏障
一、血脑屏障的结构特点
二、物质通过血脑屏障的方式
三、影响因素
第二节 脑代谢的某些特点
一、能量供应(Energy Supply)
二、类脂的组成和代谢
三、谷氨酸的代谢与功能
第三节 神经递质(Neurotransmitter)的代谢
一、乙酰胆碱(Acetylcholine简写Ach)
二、儿茶酚胺类(Catecholamines)
三、5-羟色胺(5-ydroxytryptamine 简写5-HT)
四、氨基酸和寡肽
第十五章 核酸的结构与功能The Structure and Function of Nucleic Acid
第一节 核酸的化学组成
一、元素组成
二、化学组成与基本单位
第二节 DNA的一级结构与功能
(一)DNA的一级结构
(二)基因组DNA
(三)限制性片段长度多态性
第三节 DNA的二级结构与功能
(一)DNA的二级结构?双螺旋结构模型(double helixmodel)
(二)DNA结构的多态性
(三)DNA结构的不均一性(heterogeneity)
(四)DNA的变性、复性与分子杂交
第四节 DNA的三级结构与功能
(一)DNA超螺旋
(二)染色质和核小体
第五节 RNA的结构与功能
(一)信使RNA(mRNA)与不均一核RNA(hnRNA)
(二)转运RNA(tRNA)
(三)核蛋白体RNA(rRNA)
(四)其它RNA分子
小结
复习题
第十六章 DNA的生物合成(TheBiosynthesis of DNA)
第一节 DNA的复制
一、DNA复制的方式及一般过程:
(一)DNA的半保留复制(semiconservative replication)
(二)DNA复制的一般过程:
二、DNA复制的起始阶段:
三、DNA复制的延长阶段以及参与的酶和蛋白质分子:
(一)DNA的聚合反应和DNA聚合酶
(二)与超螺旋松驰有关的酶:
四、DNA复制的终止阶段
五、真核生物DNA复制的特点:
第二节 反转录作用(reverse transcription)
小结
思考题
第三节 DNA的损伤与修复
一、DNA的损伤
二、DNA修复
小结
复习思考题
第十七章 RNA的生物合成(TheBiosynthesis of RNA)
第一节 转录作用
一、依赖DNA的RNA聚合酶
二、RNA的转录过程
(一)识别
(二)转录起始和延伸
(三)转录的终止(Termination)
第二节 RNA转录后的加工与修饰
(一)mRNA的加工修饰
(二)rRNA转录后加工
(三)tRNA转录后的加工修饰
第四节 RNA的复制
小结
思考题
第十八章 蛋白质的生物合成(The Biosynthesis of protein)
第一节 参与蛋白质生物合成的物质
(一)合成原料
(二)mRNA是合成蛋白质的直接模板
(三)tRNA是氨基酸的运载工具:
(四)核糖核蛋白体
第二节 蛋白质生物合成过程
(一)氨基酰-tRNA的生成
(二)多肽链合成的起始
(三)多肽链的延长:
(四)翻译的终止及多肽链的释放:
(五)多核糖体循环:
第三节 蛋白质合成后的分泌及加工修饰
(一)细菌中蛋白质的越膜
(二)真核生物蛋白质的分泌
(三)蛋白质翻译后加工修饰
第四节 蛋白质合成的抑制剂
(一)抗生素类阻断剂:
(二)干扰素对病毒蛋白合成的抑制
小结
思考题
第十九章 基因表达调控(Gene Expression and Its Regulation)
第一节 基因表达调控的现象和概念
一、基因表达调控是生命的必需
二、基因表达适应环境的变化
第二节 原核基因表达调控
一、操纵元的提出
二、操纵元(operon)的基本组成
(一)结构基因群
(二)启动子
(三)操纵子
(四)调控基因
(五)终止子
三、乳糖操纵元的表达调控
(一)阻遏蛋白的负性调控
(二)CAP的正性调控
四、色氨酸操纵元
(一)色氨酸操纵元的结构与阻遏蛋白的负性调控
(二)衰减子及其作用
第三节 真核基因表达调控
一、真核基因组的复杂性
二、真核基因表达调控的特点
(一)真核基因表达调控的环节更多
(二)真核基因的转录与染色质的结构变化相关
(三)真核基因表达以正性调控为主
三、真核基因转录水平的调控
(一)顺式作用组件(cis?acting elements)
(二)反式作用因子(trans?actingfactors)
本章提要
复习思考题
第二十章 DNA重组与基因工程DNARecombination and Genetic engineering
第一节 工具酶
一、限制性核酸内切酶的概念
二、限制性核酸内切酶的命名
三、限制性核酸内切酶的分类
四、限制性核酸内切酶的作用
第二节 基因工程载体
一、质粒载体
二、噬菌体载体
三、动物病毒载体
第三节 目的序列与载体的连接
一、粘性末端连接
二、平末端连接
第四节 目的基因序列的来源和分离
一、基因组DNA文库
二、cDNA文库
三、聚合酶链式反应(PCR)
四、人工化学合成
第五节 基因序列导入细胞
一、转化
二、感染
三、转染
第六节 目的基因序列克隆的筛选与鉴定
一、根据重组载体的标志作筛选
二、核酸杂交法
三、PCR法
四、免疫学方
五、DNA限制性内切酶图谱分析
六、核苷酸序列测定
第七节 克隆基因的表达
第八节 DNA重组及基因工程技术对医学和生命科学发展的贡献
一、对人类遗传信息的认识
二、基因工程药物与疫苗
三、转基因动物和植物
四、基因诊断与基因治疗
小结
复习思考题
第二十一章 细胞通讯与细胞信号转导的分子机理Cell Communication and Cell Signal Transduction
第一节 细胞通讯方式
(一)细胞间隙连接
(二)膜表面分子接触通讯
(三)化学通讯
第二节 细胞内受体的信号转导机理
第三节 膜受体介导的信号转导
一、膜受体的分类
二、膜受体信号转导的分子机理
(一)离子通道型受体及其信号转导
(二)G蛋白偶联型受体及其信号转导
(三)单次跨膜受体及其信号转导
第二十二章 癌基因与抑癌基因(Oncogene and anti-oncogene)
一、癌基因的发现
二、细胞癌基因的激活
三、抑癌基因
提要
复习题