上卷
- 一、太极图抄引
- 二、太极图（图缺）
- 三、太极图说
- 四、不知《易》者不足以言太医论
- 五、问三才所同者于人身何以见之
- 六、命门图说（图缺）
- 七、右肾水火辩
- 九、《难经正义》三焦评
- 十、问诊三焦包络
- 十一、脉义
- 十二、问十二支土多十二经火多之义
- 十三、问手心主
- 十四、手足经配合脏腑之义
- 十五、问五行金木水火土之义
- 十六、问心包络何以不得为藏
- 十八、问五行土无定体寄旺四季各一十八日何长夏一月土又独主之
- 十九、问十二经脏腑命名之义
- 二十、原呼吸
- 二十一、论诊法
- 二十二、证候推移指法
- 二十三、宗气营气卫气说
- 二十四、痢与滞下辩
- 二十五、噎膈翻胃辩
- 二十六、四时脉说
- 二十七、问伤寒桂枝汤用桂枝说
- 二十八、气郁胁痛论
- 三十、咳嗽
- 三十一、哮
- 三十二、喘
- 三十三、论汗不可纯作血看当以气看为妥
- 三十四、论五郁
- 三十五、论呕血
- 三十六、论咳血
- 三十七、论齿衄
- 三十八、颤振
- 三十九、相火篇
- 四十、泄泻辩
- 四十一、防暑论
- 四十二、痿论
- 四十三、癫狂痫辩
- 四十四、鼻鼽
- 四十五、鼻渊